홍삼의 효과는 복용하는 방법에 따라서도 달라진다. 홍삼의 주성분인 사포닌은 수용성이다. 따라서 다른 음식물이 함께 있으면 흡수에 방해를 받으며 공복에서 흡수율이 더 높다. 실제로 홍삼 제품들은 대부분 식사 전에 섭취하는 게 좋다. 다만 위장이 약한 이들은 식후 30분 정도에 복용하는 게 좋다. 또 사포닌은 고분자 물질이므로 한꺼번에 홍삼을 많이 섭취하는 것보다 하루 2~3회 나눠 복용하는 게 체내 흡수에 효과적이다.